Package qsardes.descriptor

Class DescriptorExtendedTopochemIndex

java.lang.Object
qsardes.descriptor.DescriptorExtendedTopochemIndex
All Implemented Interfaces:
Descriptor
Direct Known Subclasses:
QsarMEExtendedTopochemIndex, QsarWBExtendedTopochemIndex
public abstract class DescriptorExtendedTopochemIndex extends Object implements Descriptor
Extended topochemical index descriptors abstract class.

  • Constructor Details

    • DescriptorExtendedTopochemIndex

      protected DescriptorExtendedTopochemIndex()

  • Method Details

    • toString

      public String toString()
      Overrides:
      toString in class Object

    • get_descriptor_type

      public DescriptorType get_descriptor_type()
      Description copied from interface: Descriptor
      Gets the descriptor class type.
      Specified by:
      get_descriptor_type in interface Descriptor
      Returns:
      Descriptor class type.

    • get_descriptor_names

      public List<String> get_descriptor_names()
      Description copied from interface: Descriptor
      Gets descriptors names.
      Specified by:
      get_descriptor_names in interface Descriptor
      Returns:
      Descriptor names.

    • get_descriptor_values

      public Map<String,String> get_descriptor_values(AbstractMoleculeBuilder mol_build)
      Description copied from interface: Descriptor
      Calculates descriptors values.
      Specified by:
      get_descriptor_values in interface Descriptor
      Parameters:
      mol_build - Molecular builder representation.
      Returns:
      Descriptor values mapped as name:value.

    • standardize_nitro_groups

      protected abstract void standardize_nitro_groups()

    • get_eta_eta_b

      protected abstract double get_eta_eta_b(int atom_count, double eta_r)

    • get_mol

      protected Molecule get_mol()